Nie wiadomo, co się z nim stało po wywiezieniu przez władze sowieckie w październiku 1939 roku w głąb Rosji. Symboliczny grób ma na warszawskich Powązkach, teraz będzie miał pomnik z brązu w Białymstoku, którym rządził od 1931 roku najpierw jako komisarz rządowy, później jako wybrany prezydent miasta. Seweryn Nowakowski będzie uhonorowany w Białymstoku dzięki głosom mieszkańców oddanym na projekt budżetu obywatelskiego. 

Bez dyskusji i jednomyślnie – radni Białegostoku przyjęli uchwałę o zbudowaniu pomnika Seweryna Nowakowskiego ostatniego prezydenta Białegostoku przed wybuchem drugiej wojny światowej. Pomysł uhonorowania Nowakowskiego zgłoszono wcześniej do Budżetu Obywatelskiego na bieżący rok. Poparło go 1619 mieszkańców miasta. Głosowanie w radzie było praktycznie formalnością, bo tylko rada ma uprawnienia do stawiania w mieście pomników.