Prof. Witkowski pracuje w Zakładzie Chemii Produktów Naturalnych. Zajmuje się syntezą chemiczną i badaniami strukturalnymi, głównie witaminy E i pochodnych w aspekcie zwiększonej aktywności antyoksydacyjnej i antyrodnikowej oraz biodostępności. Badania te mają również na celu pełniejsze wyjaśnienie mechanizmu i zakresu funkcji biologicznych witaminy E. Ponadto zajmuje się syntezą organiczną w innych grupach związków naturalnych m.in. witaminy K, węglowodanów i alkaloidów.
Razem z białostockim naukowcem prezydent wręczył akty nominacyjne 32 nauczycielom akademickim oraz pracownikom nauki i sztuki.