Skrzypczak dołączył do Jagiellonii przed startem kampanii 2022/2023. Od tamtej pory rozegrał w Jadze 73 oficjalne mecze. Zdobył pięć bramek i zaliczył asystę. Od sezonu 2023/2024 regularnie występował w wyjściowej jedenastce Jagiellonii, stając się kluczową postacią bloku defensywnego. Z nim w składzie podopieczni Adriana Siemieńca sięgali po pierwszy w historii tytuł mistrzowski.
W bieżących rozgrywkach wychowanek Lecha Poznań zagrał w 10 spotkaniach ligowych i sześciu w ramach rozgrywek europejskich pucharów.