W przypadku wyeliminowania FK Novi Pazar „Żółto-Czerwoni” zmierzą się ze zwycięzcą jednej z par:
Rosenborg (NOR) - FK Banga (LTU)
Austria Wiedeń (AUT) - Spaeri FC (GRU)
Silkeborg (DEN) - KA Akureyri (ISL)
St. Patrick’s Athletic (IRL) - Nomme Kaljiu (EST)
Żalgiris Kowno (LTU) - Valur (ISL)
lub przegranym pary FC Midtjylland (DEN) - Hibernian F.C. (SCO) (drużyny grają w Lidze Europy).
Pierwszy mecz III rundy eliminacyjnej zostanie rozegrany 6 sierpnia, a rewanż tydzień później.
Jagiellonia rozpocznie udział w Lidze Konferencji od II rundy eliminacyjnej, a jej rywalem będzie serbski FK Novi Pazar (pierwsze spotkanie w Serbii 24.07, a rewanż w Białymstoku 31.07).